Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF6P49848 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TAF6P49848 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF6P49848 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF6P49848 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF6P49848 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF6P49848 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF6P49848 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF6P49848 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF6P49848 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF6P49848 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF6P49848 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF6P49848 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF6P49848 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF6P49848 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF6P49848 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF6P49848 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF6P49848 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF6P49848 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF6P49848 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF6P49848 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF6P49848 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF6P49848 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF6P49848 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF6P49848 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF6P49848 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF6P49848 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF6P49848 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF6P49848 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF6P49848 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF6P49848 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF6P49848 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF6P49848 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF6P49848 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF6P49848 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF6P49848 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TAF6P49848 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TAF6P49848 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF6P49848 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF6P49848 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF6P49848 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF6P49848 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF6P49848 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF6P49848 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF6P49848 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF6P49848 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF6P49848 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF6P49848 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF6P49848 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF6P49848 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF6P49848 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF6P49848 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF6P49848 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF6P49848 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF6P49848 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF6P49848 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF6P49848 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF6P49848 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF6P49848 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF6P49848 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF6P49848 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF6P49848 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF6P49848 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF6P49848 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF6P49848 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms