Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GSK3BP49841 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSK3BP49841 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms