Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTPAP49638 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTPAP49638 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTPAP49638 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTPAP49638 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTPAP49638 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTPAP49638 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTPAP49638 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTPAP49638 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTPAP49638 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTPAP49638 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTPAP49638 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTPAP49638 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTPAP49638 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTPAP49638 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTPAP49638 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTPAP49638 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTPAP49638 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTPAP49638 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTPAP49638 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTPAP49638 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTPAP49638 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTPAP49638 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTPAP49638 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTPAP49638 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTPAP49638 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTPAP49638 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTPAP49638 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTPAP49638 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTPAP49638 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTPAP49638 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTPAP49638 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTPAP49638 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTPAP49638 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTPAP49638 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTPAP49638 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTPAP49638 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTPAP49638 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTPAP49638 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTPAP49638 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTPAP49638 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTPAP49638 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTPAP49638 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTPAP49638 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTPAP49638 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTPAP49638 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTPAP49638 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTPAP49638 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTPAP49638 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTPAP49638 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTPAP49638 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTPAP49638 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTPAP49638 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTPAP49638 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTPAP49638 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTPAP49638 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTPAP49638 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTPAP49638 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTPAP49638 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTPAP49638 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTPAP49638 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTPAP49638 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTPAP49638 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTPAP49638 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTPAP49638 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTPAP49638 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTPAP49638 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTPAP49638 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTPAP49638 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTPAP49638 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTPAP49638 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTPAP49638 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTPAP49638 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTPAP49638 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTPAP49638 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTPAP49638 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTPAP49638 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTPAP49638 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTPAP49638 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTPAP49638 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTPAP49638 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTPAP49638 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTPAP49638 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTPAP49638 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTPAP49638 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTPAP49638 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTPAP49638 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTPAP49638 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTPAP49638 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTPAP49638 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTPAP49638 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTPAP49638 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTPAP49638 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTPAP49638 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTPAP49638 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTPAP49638 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTPAP49638 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTPAP49638 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTPAP49638 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTPAP49638 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms