Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRPC1P48995 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRPC1P48995 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms