Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TNNI2P48788 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNI2P48788 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms