Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRB2P47870 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRB2P47870 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms