Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL27AP46776 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL27AP46776 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 732.7 ms