Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRCC3P46736 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCC3P46736 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms