Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-1P43699 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-1P43699 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms