Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC4P43686 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC4P43686 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC4P43686 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC4P43686 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC4P43686 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC4P43686 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PSMC4P43686 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSMC4P43686 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms