Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYKP43405 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYKP43405 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYKP43405 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYKP43405 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYKP43405 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYKP43405 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYKP43405 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYKP43405 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYKP43405 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYKP43405 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYKP43405 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYKP43405 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYKP43405 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYKP43405 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYKP43405 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYKP43405 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYKP43405 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYKP43405 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYKP43405 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYKP43405 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYKP43405 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYKP43405 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYKP43405 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYKP43405 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYKP43405 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYKP43405 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYKP43405 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYKP43405 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYKP43405 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYKP43405 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYKP43405 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYKP43405 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYKP43405 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYKP43405 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYKP43405 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYKP43405 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYKP43405 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYKP43405 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYKP43405 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYKP43405 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYKP43405 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYKP43405 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYKP43405 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYKP43405 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYKP43405 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYKP43405 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYKP43405 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYKP43405 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYKP43405 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYKP43405 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYKP43405 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYKP43405 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYKP43405 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYKP43405 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYKP43405 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYKP43405 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYKP43405 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYKP43405 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYKP43405 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYKP43405 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYKP43405 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYKP43405 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYKP43405 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYKP43405 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYKP43405 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYKP43405 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYKP43405 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYKP43405 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYKP43405 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYKP43405 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYKP43405 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYKP43405 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYKP43405 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYKP43405 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYKP43405 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYKP43405 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYKP43405 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYKP43405 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYKP43405 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYKP43405 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYKP43405 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYKP43405 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYKP43405 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYKP43405 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYKP43405 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms