Protein–RNA interactions for Protein: P42947

YJL107C, Uncharacterized UPF0442 protein YJL107C, yeastyeast

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL107CP42947 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.76□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YBL036CYBL036C 774 nt4.76□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 WTM2YOR229W 1404 nt4.76□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 BTS1YPL069C 1008 nt4.76□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 RAD7YJR052W 1698 nt4.76□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 PRM7YDL039C 2097 nt4.76□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 RRI1YDL216C 1323 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 EUG1YDR518W 1554 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 PMT5YDL093W 2232 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 snR63snR63 255 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YDR124WYDR124W 975 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YPR1YDR368W 939 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YEL045CYEL045C 426 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YGL185CYGL185C 1140 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 POP6YGR030C 477 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 PPE1YHR075C 1203 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YJR085CYJR085C 318 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YAR061WYAR061W 204 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 SLX1YBR228W 915 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 UBA2YDR390C 1911 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 EKI1YDR147W 1605 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 MDM10YAL010C 1482 nt4.75□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 NEM1YHR004C 1341 nt4.74□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 RRP14YKL082C 1305 nt4.74□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 MPH2YDL247W 1830 nt4.74□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YMR196WYMR196W 3267 nt4.74□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 TRM8YDL201W 861 nt4.74□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 PRR2YDL214C 2100 nt4.74□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 PCT1YGR202C 1275 nt4.74□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt4.74□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 ELF1YKL160W 438 nt4.74□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.74□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 APS1YLR170C 471 nt4.74□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 ARN1YHL040C 1884 nt4.74□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 SSB2YNL209W 1842 nt4.74□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 GAS2YLR343W 1668 nt4.73□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 VHS2YIL135C 1311 nt4.73□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 KRS1YDR037W 1776 nt4.73□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 MKS1YNL076W 1755 nt4.73□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 KAP114YGL241W 3015 nt4.73□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 AKL1YBR059C 3327 nt4.73□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 THI22YPR121W 1719 nt4.73□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 DCD1YHR144C 939 nt4.73□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 IMP3YHR148W 552 nt4.73□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YIL089WYIL089W 618 nt4.73□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 RPF2YKR081C 1035 nt4.73□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 PRM9YAR031W 897 nt4.73□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 SLZ1YNL196C 897 nt4.73□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 RCK2YLR248W 1833 nt4.73□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 TAF5YBR198C 2397 nt4.73□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 PRD1YCL057W 2139 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 SHR3YDL212W 633 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 PIB1YDR313C 861 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YER084WYER084W 387 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YLR374CYLR374C 390 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 SSU72YNL222W 621 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YPL199CYPL199C 723 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 SLM4YBR077C 489 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 SRB6YBR253W 366 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 PTM1YKL039W 1572 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 RAD30YDR419W 1899 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 YBR139WYBR139W 1527 nt4.72□□□□□ -1.65
YJL107CP42947 VHC1YBR235W 3363 nt4.71□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 BUD7YOR299W 2241 nt4.71□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 RRG1YDR065W 1098 nt4.71□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 MRPL7YDR237W 879 nt4.71□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 RRP17YDR412W 708 nt4.71□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 BUD16YEL029C 939 nt4.71□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 HAT2YEL056W 1206 nt4.71□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 YFR035CYFR035C 345 nt4.71□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 NPY1YGL067W 1155 nt4.71□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt4.71□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 LAC1YKL008C 1257 nt4.71□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 YNG1YOR064C 660 nt4.71□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 SEO1YAL067C 1782 nt4.7□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 YGR125WYGR125W 3111 nt4.7□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 KGD1YIL125W 3045 nt4.7□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 ENT5YDR153C 1236 nt4.7□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 CNL1YDR357C 369 nt4.7□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 TIM21YGR033C 720 nt4.7□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 SPC3YLR066W 555 nt4.7□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 MRPL39YML009C 213 nt4.7□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 YNL226WYNL226W 411 nt4.7□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 RAD28YDR030C 1521 nt4.7□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 LAS21YJL062W 2493 nt4.7□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 TMN2YDR107C 2019 nt4.7□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 YDR444WYDR444W 2064 nt4.69□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 AIM10YER087W 1731 nt4.69□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 APC4YDR118W 1959 nt4.69□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 EGT2YNL327W 3126 nt4.69□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 CLN2YPL256C 1638 nt4.69□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 MBP1YDL056W 2502 nt4.69□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 PAD1YDR538W 729 nt4.69□□□□□ -1.66
YJL107CP42947 CLC1YGR167W 702 nt4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms