Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP12P39900 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP12P39900 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP12P39900 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP12P39900 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP12P39900 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP12P39900 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP12P39900 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP12P39900 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP12P39900 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP12P39900 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP12P39900 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP12P39900 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP12P39900 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP12P39900 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP12P39900 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP12P39900 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP12P39900 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP12P39900 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP12P39900 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP12P39900 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP12P39900 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP12P39900 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP12P39900 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP12P39900 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP12P39900 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP12P39900 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP12P39900 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP12P39900 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP12P39900 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP12P39900 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP12P39900 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP12P39900 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP12P39900 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP12P39900 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP12P39900 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP12P39900 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP12P39900 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP12P39900 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP12P39900 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP12P39900 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP12P39900 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP12P39900 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP12P39900 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP12P39900 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP12P39900 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP12P39900 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP12P39900 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP12P39900 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP12P39900 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP12P39900 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP12P39900 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP12P39900 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP12P39900 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP12P39900 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP12P39900 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP12P39900 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP12P39900 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP12P39900 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP12P39900 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP12P39900 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP12P39900 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP12P39900 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP12P39900 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP12P39900 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP12P39900 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP12P39900 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP12P39900 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP12P39900 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP12P39900 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MMP12P39900 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP12P39900 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MMP12P39900 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP12P39900 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP12P39900 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP12P39900 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP12P39900 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP12P39900 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP12P39900 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP12P39900 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP12P39900 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP12P39900 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP12P39900 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP12P39900 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP12P39900 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP12P39900 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP12P39900 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms