Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SREBF1P36956 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SREBF1P36956 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms