Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FLT4P35916 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FLT4P35916 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FLT4P35916 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FLT4P35916 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FLT4P35916 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FLT4P35916 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FLT4P35916 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FLT4P35916 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
FLT4P35916 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
FLT4P35916 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FLT4P35916 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FLT4P35916 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FLT4P35916 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
FLT4P35916 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FLT4P35916 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FLT4P35916 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FLT4P35916 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FLT4P35916 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FLT4P35916 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
FLT4P35916 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FLT4P35916 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FLT4P35916 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
FLT4P35916 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
FLT4P35916 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FLT4P35916 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FLT4P35916 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FLT4P35916 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FLT4P35916 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FLT4P35916 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FLT4P35916 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FLT4P35916 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FLT4P35916 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FLT4P35916 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FLT4P35916 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FLT4P35916 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FLT4P35916 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FLT4P35916 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FLT4P35916 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FLT4P35916 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FLT4P35916 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FLT4P35916 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FLT4P35916 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FLT4P35916 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FLT4P35916 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FLT4P35916 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FLT4P35916 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FLT4P35916 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FLT4P35916 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FLT4P35916 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FLT4P35916 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FLT4P35916 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FLT4P35916 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
FLT4P35916 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FLT4P35916 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FLT4P35916 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FLT4P35916 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FLT4P35916 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FLT4P35916 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FLT4P35916 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FLT4P35916 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
FLT4P35916 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
FLT4P35916 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FLT4P35916 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FLT4P35916 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FLT4P35916 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FLT4P35916 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FLT4P35916 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms