Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYH11P35749 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYH11P35749 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYH11P35749 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYH11P35749 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYH11P35749 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYH11P35749 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYH11P35749 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYH11P35749 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYH11P35749 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYH11P35749 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYH11P35749 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYH11P35749 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYH11P35749 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYH11P35749 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYH11P35749 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYH11P35749 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYH11P35749 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYH11P35749 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYH11P35749 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYH11P35749 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYH11P35749 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYH11P35749 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH11P35749 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH11P35749 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH11P35749 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH11P35749 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH11P35749 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH11P35749 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH11P35749 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH11P35749 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYH11P35749 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH11P35749 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH11P35749 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH11P35749 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH11P35749 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH11P35749 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH11P35749 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH11P35749 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYH11P35749 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYH11P35749 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH11P35749 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH11P35749 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYH11P35749 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH11P35749 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH11P35749 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH11P35749 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH11P35749 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH11P35749 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH11P35749 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH11P35749 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH11P35749 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYH11P35749 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH11P35749 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH11P35749 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH11P35749 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH11P35749 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH11P35749 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH11P35749 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH11P35749 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH11P35749 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH11P35749 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH11P35749 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH11P35749 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH11P35749 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH11P35749 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH11P35749 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYH11P35749 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH11P35749 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH11P35749 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH11P35749 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH11P35749 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH11P35749 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH11P35749 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH11P35749 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH11P35749 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYH11P35749 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH11P35749 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH11P35749 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH11P35749 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH11P35749 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH11P35749 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH11P35749 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH11P35749 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH11P35749 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH11P35749 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH11P35749 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH11P35749 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYH11P35749 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYH11P35749 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYH11P35749 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYH11P35749 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYH11P35749 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYH11P35749 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYH11P35749 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYH11P35749 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYH11P35749 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYH11P35749 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYH11P35749 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYH11P35749 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms