Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYLC1P35663 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYLC1P35663 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms