Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DDIT3P35638 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDIT3P35638 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDIT3P35638 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms