Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD12P35452 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms