Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNA3P32297 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHRNA3P32297 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRNA3P32297 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms