Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCKBRP32239 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms