Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TM4SF1P30408 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TM4SF1P30408 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms