Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA2P29317 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA2P29317 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms