Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARK3P27448 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARK3P27448 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MARK3P27448 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARK3P27448 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MARK3P27448 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARK3P27448 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARK3P27448 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MARK3P27448 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARK3P27448 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARK3P27448 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MARK3P27448 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARK3P27448 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MARK3P27448 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARK3P27448 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARK3P27448 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARK3P27448 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MARK3P27448 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MARK3P27448 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARK3P27448 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARK3P27448 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARK3P27448 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MARK3P27448 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARK3P27448 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARK3P27448 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MARK3P27448 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARK3P27448 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARK3P27448 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARK3P27448 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARK3P27448 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARK3P27448 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARK3P27448 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARK3P27448 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARK3P27448 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MARK3P27448 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARK3P27448 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MARK3P27448 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARK3P27448 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARK3P27448 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MARK3P27448 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MARK3P27448 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARK3P27448 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARK3P27448 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARK3P27448 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARK3P27448 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MARK3P27448 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARK3P27448 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARK3P27448 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARK3P27448 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARK3P27448 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARK3P27448 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARK3P27448 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARK3P27448 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARK3P27448 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARK3P27448 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARK3P27448 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARK3P27448 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MARK3P27448 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARK3P27448 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARK3P27448 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MARK3P27448 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARK3P27448 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARK3P27448 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARK3P27448 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MARK3P27448 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARK3P27448 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARK3P27448 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARK3P27448 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARK3P27448 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARK3P27448 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARK3P27448 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARK3P27448 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARK3P27448 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARK3P27448 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MARK3P27448 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARK3P27448 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MARK3P27448 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARK3P27448 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARK3P27448 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARK3P27448 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARK3P27448 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARK3P27448 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARK3P27448 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARK3P27448 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARK3P27448 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARK3P27448 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARK3P27448 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MARK3P27448 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARK3P27448 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARK3P27448 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARK3P27448 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARK3P27448 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARK3P27448 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARK3P27448 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARK3P27448 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARK3P27448 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARK3P27448 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARK3P27448 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARK3P27448 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MARK3P27448 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms