Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA1P25391 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA1P25391 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms