Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNCP24821 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNCP24821 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNCP24821 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNCP24821 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNCP24821 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNCP24821 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNCP24821 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNCP24821 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TNCP24821 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TNCP24821 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNCP24821 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNCP24821 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNCP24821 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNCP24821 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNCP24821 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNCP24821 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNCP24821 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNCP24821 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNCP24821 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNCP24821 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TNCP24821 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TNCP24821 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNCP24821 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNCP24821 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNCP24821 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNCP24821 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNCP24821 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNCP24821 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNCP24821 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNCP24821 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNCP24821 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNCP24821 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNCP24821 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNCP24821 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNCP24821 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNCP24821 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNCP24821 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNCP24821 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNCP24821 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNCP24821 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNCP24821 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNCP24821 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNCP24821 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNCP24821 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNCP24821 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNCP24821 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNCP24821 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNCP24821 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNCP24821 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TNCP24821 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TNCP24821 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TNCP24821 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNCP24821 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNCP24821 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNCP24821 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNCP24821 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNCP24821 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNCP24821 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNCP24821 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNCP24821 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNCP24821 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNCP24821 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNCP24821 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNCP24821 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNCP24821 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNCP24821 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNCP24821 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNCP24821 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms