Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRBP23467 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRBP23467 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms