Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EPHA1P21709 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EPHA1P21709 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms