Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NF1P21359 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NF1P21359 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NF1P21359 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NF1P21359 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NF1P21359 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NF1P21359 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NF1P21359 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NF1P21359 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NF1P21359 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NF1P21359 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NF1P21359 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NF1P21359 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NF1P21359 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NF1P21359 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NF1P21359 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NF1P21359 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NF1P21359 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NF1P21359 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NF1P21359 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NF1P21359 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NF1P21359 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NF1P21359 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NF1P21359 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NF1P21359 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NF1P21359 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NF1P21359 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NF1P21359 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NF1P21359 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NF1P21359 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NF1P21359 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NF1P21359 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NF1P21359 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NF1P21359 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NF1P21359 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NF1P21359 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NF1P21359 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NF1P21359 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NF1P21359 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NF1P21359 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NF1P21359 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NF1P21359 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NF1P21359 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NF1P21359 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NF1P21359 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NF1P21359 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NF1P21359 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NF1P21359 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NF1P21359 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NF1P21359 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NF1P21359 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NF1P21359 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NF1P21359 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NF1P21359 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NF1P21359 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NF1P21359 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NF1P21359 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NF1P21359 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NF1P21359 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NF1P21359 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NF1P21359 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NF1P21359 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NF1P21359 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NF1P21359 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NF1P21359 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NF1P21359 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NF1P21359 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NF1P21359 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms