Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD247P20963 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CD247P20963 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD247P20963 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD247P20963 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD247P20963 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD247P20963 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CD247P20963 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD247P20963 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD247P20963 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CD247P20963 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD247P20963 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD247P20963 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CD247P20963 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD247P20963 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD247P20963 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD247P20963 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD247P20963 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD247P20963 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD247P20963 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD247P20963 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD247P20963 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD247P20963 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD247P20963 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD247P20963 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CD247P20963 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CD247P20963 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD247P20963 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD247P20963 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD247P20963 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD247P20963 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CD247P20963 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CD247P20963 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD247P20963 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD247P20963 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD247P20963 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD247P20963 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD247P20963 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD247P20963 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD247P20963 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD247P20963 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD247P20963 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD247P20963 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD247P20963 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CD247P20963 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CD247P20963 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD247P20963 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD247P20963 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD247P20963 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD247P20963 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CD247P20963 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CD247P20963 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD247P20963 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD247P20963 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD247P20963 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CD247P20963 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CD247P20963 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD247P20963 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD247P20963 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD247P20963 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD247P20963 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CD247P20963 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD247P20963 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD247P20963 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD247P20963 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CD247P20963 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms