Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCN1P20061 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCN1P20061 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCN1P20061 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCN1P20061 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCN1P20061 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCN1P20061 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCN1P20061 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCN1P20061 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCN1P20061 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCN1P20061 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCN1P20061 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCN1P20061 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCN1P20061 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCN1P20061 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCN1P20061 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCN1P20061 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCN1P20061 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCN1P20061 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCN1P20061 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCN1P20061 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCN1P20061 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCN1P20061 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCN1P20061 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCN1P20061 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCN1P20061 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCN1P20061 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCN1P20061 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCN1P20061 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCN1P20061 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCN1P20061 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCN1P20061 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCN1P20061 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCN1P20061 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCN1P20061 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCN1P20061 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCN1P20061 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCN1P20061 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCN1P20061 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCN1P20061 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCN1P20061 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TCN1P20061 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCN1P20061 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCN1P20061 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCN1P20061 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCN1P20061 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCN1P20061 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCN1P20061 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCN1P20061 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCN1P20061 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCN1P20061 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCN1P20061 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCN1P20061 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCN1P20061 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCN1P20061 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCN1P20061 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCN1P20061 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCN1P20061 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCN1P20061 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCN1P20061 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCN1P20061 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCN1P20061 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCN1P20061 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCN1P20061 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCN1P20061 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCN1P20061 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCN1P20061 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCN1P20061 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCN1P20061 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCN1P20061 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms