Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB1P19838 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms