Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCLP18206 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCLP18206 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCLP18206 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCLP18206 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCLP18206 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCLP18206 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCLP18206 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCLP18206 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCLP18206 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCLP18206 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCLP18206 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCLP18206 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCLP18206 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCLP18206 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCLP18206 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCLP18206 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCLP18206 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCLP18206 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCLP18206 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCLP18206 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCLP18206 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCLP18206 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCLP18206 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCLP18206 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCLP18206 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCLP18206 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
VCLP18206 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VCLP18206 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCLP18206 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCLP18206 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCLP18206 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCLP18206 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCLP18206 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCLP18206 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCLP18206 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCLP18206 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCLP18206 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCLP18206 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCLP18206 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCLP18206 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCLP18206 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCLP18206 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCLP18206 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCLP18206 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCLP18206 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCLP18206 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCLP18206 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCLP18206 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCLP18206 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCLP18206 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCLP18206 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCLP18206 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCLP18206 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCLP18206 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCLP18206 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCLP18206 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCLP18206 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCLP18206 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCLP18206 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCLP18206 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCLP18206 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VCLP18206 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCLP18206 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCLP18206 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCLP18206 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCLP18206 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCLP18206 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCLP18206 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCLP18206 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCLP18206 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCLP18206 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCLP18206 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCLP18206 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCLP18206 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCLP18206 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCLP18206 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VCLP18206 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCLP18206 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCLP18206 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCLP18206 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCLP18206 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCLP18206 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCLP18206 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms