Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XBP1P17861 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XBP1P17861 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XBP1P17861 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XBP1P17861 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XBP1P17861 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
XBP1P17861 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XBP1P17861 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
XBP1P17861 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XBP1P17861 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XBP1P17861 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XBP1P17861 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XBP1P17861 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XBP1P17861 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XBP1P17861 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XBP1P17861 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XBP1P17861 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XBP1P17861 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XBP1P17861 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XBP1P17861 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XBP1P17861 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XBP1P17861 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XBP1P17861 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XBP1P17861 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XBP1P17861 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XBP1P17861 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XBP1P17861 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XBP1P17861 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
XBP1P17861 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XBP1P17861 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XBP1P17861 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XBP1P17861 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
XBP1P17861 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XBP1P17861 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
XBP1P17861 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XBP1P17861 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XBP1P17861 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XBP1P17861 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XBP1P17861 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XBP1P17861 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XBP1P17861 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XBP1P17861 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XBP1P17861 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XBP1P17861 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XBP1P17861 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XBP1P17861 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XBP1P17861 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XBP1P17861 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XBP1P17861 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
XBP1P17861 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XBP1P17861 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XBP1P17861 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XBP1P17861 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XBP1P17861 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XBP1P17861 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
XBP1P17861 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XBP1P17861 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XBP1P17861 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XBP1P17861 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XBP1P17861 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XBP1P17861 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XBP1P17861 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XBP1P17861 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XBP1P17861 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XBP1P17861 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XBP1P17861 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XBP1P17861 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XBP1P17861 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XBP1P17861 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XBP1P17861 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XBP1P17861 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
XBP1P17861 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XBP1P17861 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XBP1P17861 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XBP1P17861 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XBP1P17861 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XBP1P17861 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XBP1P17861 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XBP1P17861 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XBP1P17861 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XBP1P17861 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XBP1P17861 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XBP1P17861 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XBP1P17861 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XBP1P17861 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XBP1P17861 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XBP1P17861 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XBP1P17861 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XBP1P17861 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
XBP1P17861 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XBP1P17861 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XBP1P17861 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XBP1P17861 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XBP1P17861 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XBP1P17861 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XBP1P17861 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
XBP1P17861 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XBP1P17861 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
XBP1P17861 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
XBP1P17861 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms