Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMPD1P17405 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD1P17405 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms