Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPCAMP16422 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPCAMP16422 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPCAMP16422 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms