Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MUC1P15941 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MUC1P15941 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MUC1P15941 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MUC1P15941 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MUC1P15941 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MUC1P15941 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MUC1P15941 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MUC1P15941 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MUC1P15941 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MUC1P15941 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MUC1P15941 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MUC1P15941 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MUC1P15941 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MUC1P15941 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MUC1P15941 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MUC1P15941 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MUC1P15941 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MUC1P15941 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MUC1P15941 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MUC1P15941 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MUC1P15941 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MUC1P15941 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MUC1P15941 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MUC1P15941 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MUC1P15941 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MUC1P15941 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MUC1P15941 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MUC1P15941 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MUC1P15941 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MUC1P15941 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MUC1P15941 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MUC1P15941 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MUC1P15941 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MUC1P15941 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MUC1P15941 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MUC1P15941 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MUC1P15941 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MUC1P15941 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MUC1P15941 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MUC1P15941 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MUC1P15941 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MUC1P15941 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MUC1P15941 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MUC1P15941 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MUC1P15941 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MUC1P15941 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MUC1P15941 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MUC1P15941 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MUC1P15941 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MUC1P15941 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MUC1P15941 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MUC1P15941 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MUC1P15941 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MUC1P15941 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MUC1P15941 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MUC1P15941 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MUC1P15941 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MUC1P15941 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MUC1P15941 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MUC1P15941 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MUC1P15941 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MUC1P15941 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MUC1P15941 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MUC1P15941 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MUC1P15941 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MUC1P15941 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MUC1P15941 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MUC1P15941 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MUC1P15941 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MUC1P15941 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MUC1P15941 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MUC1P15941 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MUC1P15941 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MUC1P15941 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MUC1P15941 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MUC1P15941 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MUC1P15941 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MUC1P15941 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MUC1P15941 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MUC1P15941 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MUC1P15941 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MUC1P15941 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MUC1P15941 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MUC1P15941 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MUC1P15941 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MUC1P15941 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MUC1P15941 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MUC1P15941 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MUC1P15941 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MUC1P15941 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MUC1P15941 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MUC1P15941 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MUC1P15941 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MUC1P15941 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MUC1P15941 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MUC1P15941 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MUC1P15941 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MUC1P15941 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MUC1P15941 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms