Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MYOD1P15172 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MYOD1P15172 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms