Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRIM27P14373 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM27P14373 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM27P14373 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms