Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT13P13646 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT13P13646 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT13P13646 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT13P13646 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT13P13646 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT13P13646 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT13P13646 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT13P13646 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT13P13646 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT13P13646 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT13P13646 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT13P13646 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT13P13646 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT13P13646 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT13P13646 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT13P13646 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT13P13646 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT13P13646 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT13P13646 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT13P13646 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT13P13646 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT13P13646 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT13P13646 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT13P13646 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT13P13646 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT13P13646 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT13P13646 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT13P13646 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT13P13646 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT13P13646 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT13P13646 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT13P13646 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT13P13646 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT13P13646 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT13P13646 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT13P13646 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT13P13646 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT13P13646 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT13P13646 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT13P13646 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT13P13646 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT13P13646 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT13P13646 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT13P13646 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT13P13646 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT13P13646 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT13P13646 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT13P13646 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT13P13646 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT13P13646 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT13P13646 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT13P13646 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT13P13646 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT13P13646 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT13P13646 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT13P13646 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT13P13646 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT13P13646 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT13P13646 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT13P13646 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT13P13646 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT13P13646 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT13P13646 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT13P13646 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT13P13646 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT13P13646 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT13P13646 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT13P13646 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT13P13646 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT13P13646 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT13P13646 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT13P13646 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT13P13646 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT13P13646 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT13P13646 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT13P13646 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT13P13646 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT13P13646 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT13P13646 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT13P13646 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT13P13646 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT13P13646 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT13P13646 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT13P13646 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT13P13646 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT13P13646 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT13P13646 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT13P13646 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT13P13646 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT13P13646 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT13P13646 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT13P13646 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT13P13646 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT13P13646 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT13P13646 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT13P13646 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT13P13646 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT13P13646 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT13P13646 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms