Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF5P13349 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF5P13349 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF5P13349 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF5P13349 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF5P13349 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF5P13349 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF5P13349 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF5P13349 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF5P13349 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF5P13349 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF5P13349 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF5P13349 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF5P13349 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF5P13349 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MYF5P13349 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MYF5P13349 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF5P13349 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF5P13349 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF5P13349 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF5P13349 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF5P13349 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF5P13349 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF5P13349 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF5P13349 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF5P13349 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF5P13349 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF5P13349 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF5P13349 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MYF5P13349 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF5P13349 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF5P13349 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF5P13349 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF5P13349 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF5P13349 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF5P13349 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF5P13349 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF5P13349 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF5P13349 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MYF5P13349 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MYF5P13349 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYF5P13349 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYF5P13349 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYF5P13349 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MYF5P13349 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MYF5P13349 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYF5P13349 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYF5P13349 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYF5P13349 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYF5P13349 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYF5P13349 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYF5P13349 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYF5P13349 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MYF5P13349 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYF5P13349 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYF5P13349 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYF5P13349 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYF5P13349 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MYF5P13349 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYF5P13349 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYF5P13349 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYF5P13349 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms