Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VPREB1P12018 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms