Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HKR1P10072 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HKR1P10072 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HKR1P10072 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HKR1P10072 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HKR1P10072 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HKR1P10072 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HKR1P10072 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HKR1P10072 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HKR1P10072 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HKR1P10072 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HKR1P10072 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HKR1P10072 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HKR1P10072 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HKR1P10072 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HKR1P10072 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HKR1P10072 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HKR1P10072 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HKR1P10072 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HKR1P10072 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HKR1P10072 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HKR1P10072 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HKR1P10072 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HKR1P10072 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HKR1P10072 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HKR1P10072 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HKR1P10072 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HKR1P10072 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HKR1P10072 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HKR1P10072 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HKR1P10072 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HKR1P10072 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HKR1P10072 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HKR1P10072 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HKR1P10072 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HKR1P10072 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HKR1P10072 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HKR1P10072 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HKR1P10072 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HKR1P10072 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HKR1P10072 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HKR1P10072 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HKR1P10072 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HKR1P10072 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HKR1P10072 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HKR1P10072 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HKR1P10072 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HKR1P10072 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HKR1P10072 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HKR1P10072 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HKR1P10072 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HKR1P10072 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HKR1P10072 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HKR1P10072 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
HKR1P10072 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HKR1P10072 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HKR1P10072 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HKR1P10072 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HKR1P10072 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HKR1P10072 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HKR1P10072 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HKR1P10072 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HKR1P10072 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HKR1P10072 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HKR1P10072 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HKR1P10072 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HKR1P10072 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HKR1P10072 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HKR1P10072 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HKR1P10072 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HKR1P10072 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HKR1P10072 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HKR1P10072 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HKR1P10072 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HKR1P10072 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HKR1P10072 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HKR1P10072 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HKR1P10072 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HKR1P10072 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HKR1P10072 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HKR1P10072 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HKR1P10072 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HKR1P10072 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HKR1P10072 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HKR1P10072 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HKR1P10072 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HKR1P10072 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms