Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GLI2P10070 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GLI2P10070 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GLI2P10070 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GLI2P10070 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GLI2P10070 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GLI2P10070 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GLI2P10070 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GLI2P10070 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GLI2P10070 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GLI2P10070 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GLI2P10070 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
GLI2P10070 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GLI2P10070 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GLI2P10070 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
GLI2P10070 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.18
GLI2P10070 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
GLI2P10070 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
GLI2P10070 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
GLI2P10070 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GLI2P10070 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
GLI2P10070 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
GLI2P10070 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GLI2P10070 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GLI2P10070 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GLI2P10070 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GLI2P10070 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GLI2P10070 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GLI2P10070 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GLI2P10070 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GLI2P10070 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GLI2P10070 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GLI2P10070 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GLI2P10070 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GLI2P10070 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GLI2P10070 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GLI2P10070 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GLI2P10070 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GLI2P10070 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
GLI2P10070 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GLI2P10070 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GLI2P10070 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GLI2P10070 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
GLI2P10070 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
GLI2P10070 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
GLI2P10070 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GLI2P10070 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GLI2P10070 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GLI2P10070 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GLI2P10070 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GLI2P10070 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GLI2P10070 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GLI2P10070 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GLI2P10070 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
GLI2P10070 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
GLI2P10070 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GLI2P10070 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
GLI2P10070 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
GLI2P10070 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GLI2P10070 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GLI2P10070 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GLI2P10070 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI2P10070 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI2P10070 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI2P10070 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI2P10070 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI2P10070 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI2P10070 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI2P10070 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI2P10070 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI2P10070 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI2P10070 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI2P10070 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI2P10070 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI2P10070 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
GLI2P10070 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
GLI2P10070 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
GLI2P10070 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
GLI2P10070 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
GLI2P10070 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
GLI2P10070 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
GLI2P10070 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GLI2P10070 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GLI2P10070 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GLI2P10070 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GLI2P10070 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GLI2P10070 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GLI2P10070 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GLI2P10070 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
GLI2P10070 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
GLI2P10070 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
GLI2P10070 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GLI2P10070 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GLI2P10070 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GLI2P10070 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GLI2P10070 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GLI2P10070 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
GLI2P10070 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GLI2P10070 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GLI2P10070 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms