Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
CBSLP0DN79 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBSLP0DN79 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms