Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM10L2BP0DMW5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM10L2BP0DMW5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms