Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P0DMU3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P0DMU3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P0DMU3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P0DMU3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P0DMU3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P0DMU3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P0DMU3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P0DMU3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P0DMU3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0DMU3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0DMU3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0DMU3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0DMU3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0DMU3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0DMU3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0DMU3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0DMU3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0DMU3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0DMU3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0DMU3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0DMU3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0DMU3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P0DMU3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P0DMU3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0DMU3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0DMU3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0DMU3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0DMU3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0DMU3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0DMU3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P0DMU3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0DMU3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0DMU3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P0DMU3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0DMU3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P0DMU3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0DMU3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0DMU3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P0DMU3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P0DMU3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0DMU3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0DMU3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0DMU3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0DMU3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0DMU3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P0DMU3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0DMU3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0DMU3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0DMU3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0DMU3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P0DMU3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0DMU3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0DMU3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0DMU3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0DMU3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0DMU3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0DMU3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0DMU3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0DMU3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0DMU3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0DMU3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0DMU3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P0DMU3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms