Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
C8orf88P0DMB2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C8orf88P0DMB2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms