Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RGPD2P0DJD1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RGPD2P0DJD1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms