Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PABPC4LP0CB38 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PABPC4LP0CB38 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PABPC4LP0CB38 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PABPC4LP0CB38 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PABPC4LP0CB38 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PABPC4LP0CB38 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PABPC4LP0CB38 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PABPC4LP0CB38 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PABPC4LP0CB38 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PABPC4LP0CB38 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PABPC4LP0CB38 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PABPC4LP0CB38 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PABPC4LP0CB38 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PABPC4LP0CB38 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PABPC4LP0CB38 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PABPC4LP0CB38 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms